合法的，办理土地证，收取出让金是合法的。
商品房办理土地证前需要先办好房权证，按如下流程办理：
1、购房者办好房权证后，携带身份证、房产证、土地证总证复印件、合同、房屋办证的契税发票等材料原件及复印件，到土管部门申请办理土地证；
2、开发商在出售完商品房后，把土地证总证面积根据购房者的房屋所占面积数据分割多个小证数据；土管部门工作人员受理后进入审批程序；因办房权证已经缴纳契税等费用，只需缴纳登记费（工本费）即可。
法院在拍卖土地时应通过拍卖机构进行拍卖，可以要求拍卖行出具名细对房屋、土地进行分割，按照实际购买价和相关税费进行入帐。房屋记入企业固定资产，土地记入企业无形资产。
这牵扯到拍卖佣金的问题。除缴纳拍卖佣金外，竞拍者还需缴纳房屋过户的费用。
依据《中华人民共和国拍卖法》的规定，对委托人、买受人对收取的佣金比例、收取方式和期限制定如下标准：
一、 委托人佣金支付方式及期限
1、佣金比例
依据《中华人民共和国拍卖法》的规定，对拍卖任意物品和公物收取不同比例的佣金：
① 委托人与拍卖人之前有约定的，按约定收取
② 委托人与拍卖人未做约定的，拍卖人可以向委托人收取不超过拍卖成交价5%的佣金
③ 艺术品拍卖收取佣金比例一般为10%(国际惯例)
2、佣金支付方式
① 前期支付法：签订《委托拍卖合同》后，在约定的期限内由委托人按合同约定支付。
② 扣除法：委托人在拍卖人拍卖成交后，拍卖人在向委托人支付成交价款时扣除。
3、佣金支付的期限
① 前期支付法：委托人在签订《委托拍卖合同》后三个工作日支付。
② 扣除法：拍卖成交后，拍卖人直接从成交价款中扣除。
